县农业局现有直属单位11个，除农业行政执法大队属管理执法型事业单位外，其余都属社会技术服务型事业单位。
1、县农业技术推广中心：种植业技术引进、试验示范、种植业技术规范制定，种植业新技术、新成果的推广，《农业技术推广法》的宣传监督，种植业技术推广业务指导，种植业技术承包，成果转让，组织相关农业项目的实施。主要负责人：程玉家。联系电话：7071185。
2、县农业干部学校：种植业系统技术培训，种植业项目技术培训，种植业“绿色证书”培训，县、镇、村干部的种植业技术培训，承担省农广校教学业务活动，农村基层干部和农民的职业成人教育和培训，全县农技人员岗位执业资格教育培训。主要负责人：高善兵。联系电话：7076901。
3、县农业科学研究所：承担全县种植业新品种、新技术的适应性科研、试验、示范工作，承担省、市农作物新品种、新技术、新农药的验试、示范，承担国家级、省级农作物新品种黄淮海区域试验和中间试验。引进、推广农业新品种、新技术，承担全县主体农作物品种的提纯复壮和繁育，推进全县种子产业发展。主要负责人：杨余清。联系电话：7237927。
4、县植保植检站：农业植物疫情管理、封锁控制，农业植物检疫审批，农业植物检疫隔离试种，农业植物产地、调运检疫，农作物病虫草害灾情分析、治理、组织综合防治，农作物病虫草害综防技术研究开发，农作物病虫草害防治新技术试验、示范、推广，农作物病虫草害防治项目实施，农用药械安全使用指导。主要负责人：宋贤利。联系电话：7380117。
5、施庄农作物病虫测报站（水稻区）、东沟农作物病虫测报站（棉旱区）：农作物病虫草害的动态监察（预测预报），农作物病虫草害调查方法研究、测报技术研发，农作物病虫草害测报计算机网络建设、信息传递，农作物病虫草害防治新技术、新农药的引进试验、示范。主要负责人：王玉国、孙艾萍。联系电话：7381025。
6、县农作物栽培指导站：协助全县制定长期、中期、年度农业发展总体规划，搞好农作物高产、高效技术研究。及时准确为领导提供农作物生产情况。全县农作物生产技术的引进、示范、试验、推广和田间技术指导，种植业结构调整技术规划的制定、实施，国家、省级种植业项目的审报和实施，种植业实用技术的宣传、推广，种植业技术承包。主要负责人：张达余。联系电话：7380140。
7、县土壤肥料站（增挂“阜宁县农业环境监察站”和“县农产品检测中心”牌子）：土壤保护技术推广、耕地保护技术推广、肥料使用技术推广，土壤监测、检验、分析评价，肥料环境影响监测，肥料检验、肥效分析评价，农田环境污染监测及环境分析评价。土肥项目实施、成果转让及技术信息服务。种植业农产品质量检测。主要负责人：刘书进。联系电话：7380042。
8、县蔬菜产业办公室（县蔬菜生产技术指导站）：负责制定全县蔬菜产业化生产、加工、销售的宏观规划和中、短期安排，落实县委、县政府农业结构调整中蔬菜特经任务目标的考核，并做好调研汇报工作。承担蔬菜特经的标准化生产和品牌申报工作。做好蔬菜特经产销信的搜集、论证、发布、组织等有关工作。制定全县蔬菜生产技术规划，蔬菜生产技术指导，蔬菜新品种、新技术的引进、试验、示范、推广，实施“萝卜产业化”，参与县农业科技示范园区的建设。主要负责人：王乃宁。联系电话：7076910。
9、县种子管理站：农作物种子质量检验、农作物种子质量监督、农作物种子质量认证、农作物种子质量标准化管理。农作物新品种小区试验、生产试验、区域试验管理，农作物种子生产、经营、加工人员的业务技术培训，农作物种子生产、经营许可证管理。主要负责人：刘建农。联系电话：7071192。
10、县农业标准化办公室：宣传贯彻农产品质量标准，绿色、无公害农产品品牌申报，农产品标准化基地建设，全县种植业标准化生产的规划、指导和考核，协助做好县城各菜场放心菜质量控制工作。主要负责人：刘建农。联系电话：7071183。
11、农业行政执法大队：负责《中华人民共和国种子 法》的宣传、执法工作，种植业行政综合执法工作，依照法律法规查处种植业种子违法案件，全县种子市场检查整治，打击各种违法生产、经营种子的坑农害农行为，保护种植业种子生产、经营者的合法权益。主要负责人：季丰明。联系电话：7071182。
