县农业局内设4个职能科（室），均为股级。
（1）办公室：
主要职能：协助局领导处理日常工作，协调机关政务工作；组织、承办和协调综合性会议和重要活动；负责全局综合性文秘工作；负责本系统对外交流、外事外经和国际合作；负责局机关及直属事业单位的人事、机构编制和劳动工资等工作；承办农业系列中初级技术职称评审和局系统专业技术人员聘任的有关工作；负责人事档案、计划生育工作；归口管理群团工作；负责政务、文电、新闻宣传、保密、保卫、信访、督查、档案管理；协调办理人大、政协的提议案；拟定局机关有关规章制度并组织实施；负责农业行政执法的协调和监督；负责拟定种植业科技、教育、技术推广发展规划与政策，组织实施科技创新工作和科教兴农战略；协调全县农科教结合工作；管理种植业科技成果和技术推广工作；指导种植业教育工作；指导农业社会化服务体系建设，负责种植业技术推广体系建设。重要负责人：嵇仁干。联系电话：7071180。
（2）农业生产科（挂“农业信息中心”牌子）：
主要职能：研究提出种植业中长期发展规划和年度计划，引导种植业产业结构的合理调整、农业资源的合理配置；综合种植业生产情况，组织起草有关综合性报告和文件；具体负责种植业生产的规划、管理与协调；参与实施种植业标准化工作；承办基本农田保护、质量建设及相关管理；指导救灾备荒种子、化肥等生产资料的调拨；参与农业现代化试点与科技示范园区建设工作；研究提出大宗农产品和农业生产资料市场体系建设与发展规划并指导实施，促进种植业产前、产中、产后一体化；负责农产品合作流通工作，指导、协调农产品合作流通组织和农民经纪人队伍建设与管理工作；负责农业信息工作，承办农业信息网络建设，预测并发布农产品及农业生产资料供求情况等农业信息；提出大宗农产品和重要的农业生产资料的流通、价格及农业财政补贴政策建议。重要负责人：刘建农。联系电话：7071183。
（3）财务审计科：
主要职能：承办机关财务管理工作；负责机关后勤管理；负责老干部服务工作；指导本系统内部审计工作，承担局系统内部审计；指导行业和局直属单位财务管理；监督局机关和直属单位国有资产管理；参与指导棉花原种场和稻麦原种场的经营管理和改革工作；负责制定农业局所属企业的发展规划，承担农业局所属企业的生产经营管理；具体负责种植业建设项目的遴选，参与论证、审批、申报和管理工作。重要负责人：董德龙。联系电话：7071186。
（4）农业政策法规科（挂“农业行政执法大队”牌子）：
主要职能：负责宣传和贯彻落实有关种植业法律、法规和方针、政策；承办种植业产业政策、措施的起草和监督检查工作；指导农业法制宣传教育；承办农业行政应诉工作；指导农业可持续发展工作；承办农业用地、农村可再生能源综合开发与利用工作，以及种植业生物物种资源的保护和管理；组织生态农业建设，承担绿色食品、无公害农产品和名牌农产品的申报、管理工作；承办《农作物种子生产经营许可证管理办法》赋予的对全县农作物种子生产许可证、经营许可证的审查核发管理职能；负责种子的生产经营管理、种子市场质量管理、种子生产和检验人员培训的管理等工作；负责种植业行政综合执法工作，依照法律法规，查处种植业违法案件，打击各种违法生产和经营等坑农害农行为，保护种植业生产、经营者的合法权益，促进农业健康发展。重要负责人：刘训果。联系电话：7071181。
另按有关规定设置纪检（监察）机构。